台湾在水产科技产业具有强大潜能与优势，在新品种开发、种苗培育、繁殖与生产、养殖管理技术、饲料生产及行销系统等策略，皆已发展完整之水产养殖产业技术，在国际市场上占重要一席之地。台湾水产养殖兴盛，于养殖科技方面，一直维持高度的竞争优势，石斑鱼及金目鲈皆会遭受神经坏死病毒及虹彩病毒之攻击。有关会遭受感染神经坏死病毒 之鱼类全球超过120多种，而虹彩病毒会感染超过 40 种以上之鱼种，侵害甚钜。本项技术包括已开发可专一性抑制 NNV 与 GIV之壳蛋白表现小片段干扰RNA核酸分子，另一技术则为核酸包复系统，系透过脂质体将核酸包复，核酸透过脂质体保护，可顺利抵达鱼只的尾肠，提高有效性，且施用便利，为破坏性创新技术。
近年来，雄性虾苗在水产养殖产业中已备受瞩目，为一项受关注的创新技术。这一方法不仅提升了泰国虾养殖业的生产效益，也为持续性水产养殖提供了新的前景。伪雌性种虾是指在养殖过程中使用生物科技方法促使泰国虾改变表征，其性别为雄性，此技术通过第一阶段种苗的生产进而挑选出健康且品质高的。一般而言，泰国虾通常的雄性比例为35%，雄性泰国虾受到养殖业者的喜爱，因为它们生长更快，并且具有更高的价值，因此建立伪雌性种虾进而产下多雄性虾苗，能够使泰国虾产业更有效地提高产量，减少竞争和环境影响。种虾筛选是水产养殖过程中的关键步骤，以确保健康、优质的种虾生产健康优质的种苗。